Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms