Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms