Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms