Protein–RNA interactions for Protein: Q2WEN9

CEACAM16, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 16, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM16Q2WEN9 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM16Q2WEN9 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms