Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL40Q2TBA0 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms