Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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