Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SF1Q15637 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SF1Q15637 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SF1Q15637 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SF1Q15637 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SF1Q15637 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SF1Q15637 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SF1Q15637 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SF1Q15637 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SF1Q15637 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SF1Q15637 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SF1Q15637 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SF1Q15637 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SF1Q15637 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SF1Q15637 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SF1Q15637 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SF1Q15637 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SF1Q15637 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SF1Q15637 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SF1Q15637 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SF1Q15637 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SF1Q15637 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SF1Q15637 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SF1Q15637 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SF1Q15637 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SF1Q15637 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SF1Q15637 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SF1Q15637 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SF1Q15637 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SF1Q15637 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SF1Q15637 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SF1Q15637 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SF1Q15637 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SF1Q15637 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SF1Q15637 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SF1Q15637 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SF1Q15637 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SF1Q15637 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SF1Q15637 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SF1Q15637 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SF1Q15637 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SF1Q15637 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SF1Q15637 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SF1Q15637 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SF1Q15637 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SF1Q15637 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SF1Q15637 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SF1Q15637 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SF1Q15637 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SF1Q15637 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SF1Q15637 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SF1Q15637 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SF1Q15637 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SF1Q15637 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SF1Q15637 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SF1Q15637 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SF1Q15637 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SF1Q15637 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SF1Q15637 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SF1Q15637 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SF1Q15637 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SF1Q15637 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SF1Q15637 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SF1Q15637 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SF1Q15637 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SF1Q15637 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SF1Q15637 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SF1Q15637 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SF1Q15637 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SF1Q15637 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SF1Q15637 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SF1Q15637 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SF1Q15637 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SF1Q15637 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SF1Q15637 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SF1Q15637 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SF1Q15637 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SF1Q15637 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SF1Q15637 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SF1Q15637 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SF1Q15637 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SF1Q15637 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SF1Q15637 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SF1Q15637 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SF1Q15637 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SF1Q15637 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SF1Q15637 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SF1Q15637 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SF1Q15637 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SF1Q15637 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SF1Q15637 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SF1Q15637 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SF1Q15637 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SF1Q15637 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SF1Q15637 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SF1Q15637 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SF1Q15637 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SF1Q15637 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SF1Q15637 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SF1Q15637 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms