Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
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TRAM2Q15035 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAM2Q15035 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAM2Q15035 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAM2Q15035 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAM2Q15035 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAM2Q15035 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAM2Q15035 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAM2Q15035 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAM2Q15035 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAM2Q15035 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAM2Q15035 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAM2Q15035 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAM2Q15035 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAM2Q15035 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAM2Q15035 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAM2Q15035 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAM2Q15035 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAM2Q15035 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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