Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB39AQ14964 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms