Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
C1orf61Q13536 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms