Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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TOP3AQ13472 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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