Protein–RNA interactions for Protein: Q13349

ITGAD, Integrin alpha-D, humanhuman

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGADQ13349 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGADQ13349 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms