Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.32e-9■■■□□ 15
PABPC4Q13310 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.282e-9■■■□□ 15
PABPC4Q13310 MED16-210ENST00000606248 3181 ntTSL 1 (best)15.36■□□□□ 0.052e-9■■■□□ 15
PABPC4Q13310 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.042e-9■■■□□ 15
PABPC4Q13310 MED16-204ENST00000395808 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.062e-9■■■□□ 15
PABPC4Q13310 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.771e-7■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 FUS-203ENST00000474990 827 ntTSL 327.6■■■□□ 2.011e-7■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 FTL-201ENST00000331825 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.146e-60■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 NDUFS8-214ENST00000531796 615 ntTSL 318.31■□□□□ 0.528e-7■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 AGTRAP-207ENST00000471765 717 ntTSL 39.53□□□□□ -0.882e-6■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.367e-9■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.27e-9■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 MUC1-219ENST00000485118 666 ntTSL 322.1■■□□□ 1.137e-9■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.017e-9■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.567e-9■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 MUC1-214ENST00000462317 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 318.3■□□□□ 0.527e-9■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.477e-9■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.337e-9■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 MUC1-222ENST00000610468 1162 ntTSL 1 (best)17.06■□□□□ 0.327e-9■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.17e-9■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 MUC1-207ENST00000368392 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.067e-9■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 MUC1-208ENST00000368393 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.067e-9■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 MUC1-213ENST00000462215 1189 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.067e-9■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.047e-9■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 MUC1-227ENST00000615517 951 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.027e-9■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 MUC1-221ENST00000610359 1101 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.027e-9■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 SEMA4C-205ENST00000474420 2625 ntTSL 220.61■□□□□ 0.892e-7■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.442e-7■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 SEMA4C-204ENST00000467747 3371 ntTSL 215.95■□□□□ 0.142e-7■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 SEMA4C-206ENST00000482925 3776 ntTSL 214.78□□□□□ -0.042e-7■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 BTG2-202ENST00000475157 1275 ntTSL 518.69■□□□□ 0.585e-10■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 BTG2-201ENST00000290551 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.315e-10■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 SNF8-211ENST00000512243 863 ntTSL 210.97□□□□□ -0.652e-11■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.252e-12■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.682e-12■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.242e-12■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.094e-7■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.754e-7■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 RNH1-207ENST00000524464 624 ntTSL 521.39■■□□□ 1.014e-7■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 GPBP1-208ENST00000514387 3310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.833e-6■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 GPBP1-203ENST00000424459 4683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.93e-6■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.613e-6■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.663e-6■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.693e-6■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.852e-6■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 AATF-203ENST00000615319 2044 nt15.59■□□□□ 0.092e-6■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 AATF-207ENST00000617141 586 ntTSL 213.84□□□□□ -0.192e-6■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 AATF-205ENST00000616392 474 ntTSL 211.11□□□□□ -0.632e-6■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 AATF-204ENST00000616062 507 ntTSL 510.31□□□□□ -0.762e-6■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 AATF-209ENST00000622432 376 ntTSL 29.71□□□□□ -0.862e-6■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 AATF-206ENST00000616434 502 ntTSL 38.23□□□□□ -1.092e-6■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 SERF2-216ENST00000486144 1030 ntTSL 214.51□□□□□ -0.092e-32■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 RPL35A-204ENST00000442341 517 ntTSL 35.29□□□□□ -1.561e-39■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 FKBP4-201ENST00000001008 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.293e-8■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.576e-12■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 AHSA1-209ENST00000555729 621 ntTSL 318.48■□□□□ 0.556e-12■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 AHSA1-206ENST00000555457 641 ntTSL 318.48■□□□□ 0.556e-12■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 AHSA1-213ENST00000557476 584 ntTSL 318.48■□□□□ 0.556e-12■■■□□ 14.9
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PABPC4Q13310 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.43e-8■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.014e-11■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 AL162258.1-203ENST00000472233 637 ntTSL 317.36■□□□□ 0.379e-19■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 AL162258.1-202ENST00000484413 508 ntTSL 26.39□□□□□ -1.399e-19■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 GUK1-237ENST00000495999 555 ntTSL 318.97■□□□□ 0.634e-7■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 GUK1-211ENST00000412265 1012 ntTSL 516.31■□□□□ 0.24e-7■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.39e-9■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.299e-9■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.219e-9■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.869e-9■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 CIZ1-205ENST00000372948 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.189e-9■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 CIZ1-228ENST00000634901 3462 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.219e-9■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 CIZ1-225ENST00000538431 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.419e-9■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.961e-6■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.251e-6■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.181e-6■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 SMIM8-205ENST00000448282 1214 ntTSL 1 (best)13.69□□□□□ -0.224e-6■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 SMIM8-207ENST00000608525 735 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.384e-6■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 SMIM8-204ENST00000392863 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.444e-6■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 RAB3GAP2-202ENST00000358951 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.494e-6■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 SMIM8-206ENST00000608353 2111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.684e-6■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 SMIM8-203ENST00000369572 737 ntTSL 510.77□□□□□ -0.694e-6■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 SMIM8-201ENST00000229570 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.784e-6■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.51e-8■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.371e-8■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.361e-8■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.171e-8■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 SSFA2-203ENST00000409136 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.671e-8■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 SSFA2-206ENST00000440623 5420 ntTSL 28.16□□□□□ -1.11e-8■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 SSFA2-204ENST00000416081 5067 ntTSL 1 (best)7.79□□□□□ -1.161e-8■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 SSFA2-213ENST00000491720 6473 ntTSL 26.66□□□□□ -1.341e-8■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.168e-9■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 RFLNA-203ENST00000389727 2385 ntAPPRIS P2 TSL 522.17■■□□□ 1.148e-9■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.388e-9■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.238e-9■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.218e-9■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 RFLNA-204ENST00000545615 449 ntTSL 314.12□□□□□ -0.158e-9■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 ZNF664-201ENST00000337815 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.58e-9■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.526e-7■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.526e-7■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 ZNF581-202ENST00000585995 591 ntTSL 322.88■■□□□ 1.256e-7■■■□□ 14.9
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