Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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