Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSPB3Q12988 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSPB3Q12988 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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