Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPRL3Q12980 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms