Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
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