Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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GTF3C1Q12789 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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GTF3C1Q12789 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF3C1Q12789 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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GTF3C1Q12789 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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GTF3C1Q12789 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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GTF3C1Q12789 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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GTF3C1Q12789 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
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