Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD47Q08722 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD47Q08722 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD47Q08722 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD47Q08722 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD47Q08722 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD47Q08722 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD47Q08722 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD47Q08722 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD47Q08722 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD47Q08722 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD47Q08722 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD47Q08722 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD47Q08722 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CD47Q08722 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CD47Q08722 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD47Q08722 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD47Q08722 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD47Q08722 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD47Q08722 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD47Q08722 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD47Q08722 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD47Q08722 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD47Q08722 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD47Q08722 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD47Q08722 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD47Q08722 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD47Q08722 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD47Q08722 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD47Q08722 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD47Q08722 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD47Q08722 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD47Q08722 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD47Q08722 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD47Q08722 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD47Q08722 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD47Q08722 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD47Q08722 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CD47Q08722 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD47Q08722 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CD47Q08722 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CD47Q08722 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD47Q08722 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD47Q08722 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD47Q08722 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD47Q08722 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD47Q08722 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD47Q08722 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD47Q08722 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD47Q08722 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD47Q08722 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD47Q08722 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD47Q08722 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD47Q08722 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD47Q08722 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD47Q08722 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD47Q08722 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD47Q08722 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD47Q08722 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD47Q08722 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD47Q08722 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD47Q08722 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD47Q08722 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD47Q08722 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD47Q08722 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD47Q08722 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD47Q08722 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD47Q08722 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD47Q08722 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD47Q08722 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD47Q08722 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD47Q08722 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD47Q08722 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CD47Q08722 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD47Q08722 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD47Q08722 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD47Q08722 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD47Q08722 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD47Q08722 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD47Q08722 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD47Q08722 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD47Q08722 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD47Q08722 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD47Q08722 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD47Q08722 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD47Q08722 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD47Q08722 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD47Q08722 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD47Q08722 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CD47Q08722 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD47Q08722 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD47Q08722 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CD47Q08722 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD47Q08722 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD47Q08722 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD47Q08722 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD47Q08722 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD47Q08722 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD47Q08722 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD47Q08722 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms