Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms