Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUCB1Q02818 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUCB1Q02818 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms