Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms