Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
CDC42EP1Q00587 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC42EP1Q00587 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC42EP1Q00587 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC42EP1Q00587 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC42EP1Q00587 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC42EP1Q00587 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC42EP1Q00587 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC42EP1Q00587 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC42EP1Q00587 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC42EP1Q00587 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC42EP1Q00587 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC42EP1Q00587 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC42EP1Q00587 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC42EP1Q00587 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC42EP1Q00587 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC42EP1Q00587 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC42EP1Q00587 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC42EP1Q00587 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC42EP1Q00587 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC42EP1Q00587 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC42EP1Q00587 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC42EP1Q00587 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC42EP1Q00587 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC42EP1Q00587 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC42EP1Q00587 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC42EP1Q00587 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC42EP1Q00587 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC42EP1Q00587 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC42EP1Q00587 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC42EP1Q00587 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC42EP1Q00587 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC42EP1Q00587 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDC42EP1Q00587 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDC42EP1Q00587 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDC42EP1Q00587 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDC42EP1Q00587 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDC42EP1Q00587 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDC42EP1Q00587 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms