Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITPNAQ00169 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms