Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms