Protein–RNA interactions for Protein: P62987

UBA52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA52P62987 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA52P62987 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA52P62987 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA52P62987 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA52P62987 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA52P62987 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA52P62987 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA52P62987 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA52P62987 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA52P62987 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA52P62987 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA52P62987 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA52P62987 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA52P62987 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA52P62987 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA52P62987 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA52P62987 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA52P62987 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA52P62987 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA52P62987 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA52P62987 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA52P62987 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA52P62987 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA52P62987 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA52P62987 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA52P62987 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA52P62987 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA52P62987 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA52P62987 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA52P62987 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA52P62987 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA52P62987 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA52P62987 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA52P62987 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA52P62987 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA52P62987 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA52P62987 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA52P62987 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA52P62987 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA52P62987 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA52P62987 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA52P62987 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA52P62987 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA52P62987 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA52P62987 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA52P62987 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA52P62987 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA52P62987 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA52P62987 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA52P62987 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA52P62987 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA52P62987 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA52P62987 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA52P62987 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA52P62987 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA52P62987 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA52P62987 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBA52P62987 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBA52P62987 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBA52P62987 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBA52P62987 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBA52P62987 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBA52P62987 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBA52P62987 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBA52P62987 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
UBA52P62987 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBA52P62987 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBA52P62987 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBA52P62987 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBA52P62987 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBA52P62987 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBA52P62987 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBA52P62987 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBA52P62987 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBA52P62987 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBA52P62987 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBA52P62987 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBA52P62987 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBA52P62987 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBA52P62987 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
UBA52P62987 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBA52P62987 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBA52P62987 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBA52P62987 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBA52P62987 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBA52P62987 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBA52P62987 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBA52P62987 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBA52P62987 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBA52P62987 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBA52P62987 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBA52P62987 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBA52P62987 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBA52P62987 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBA52P62987 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBA52P62987 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBA52P62987 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBA52P62987 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBA52P62987 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBA52P62987 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms