Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UFM1P61960 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UFM1P61960 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UFM1P61960 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UFM1P61960 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UFM1P61960 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UFM1P61960 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UFM1P61960 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UFM1P61960 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UFM1P61960 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UFM1P61960 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UFM1P61960 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
UFM1P61960 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UFM1P61960 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UFM1P61960 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UFM1P61960 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UFM1P61960 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UFM1P61960 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UFM1P61960 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UFM1P61960 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
UFM1P61960 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UFM1P61960 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UFM1P61960 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UFM1P61960 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UFM1P61960 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UFM1P61960 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
UFM1P61960 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UFM1P61960 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UFM1P61960 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UFM1P61960 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UFM1P61960 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UFM1P61960 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UFM1P61960 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UFM1P61960 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UFM1P61960 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UFM1P61960 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UFM1P61960 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UFM1P61960 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UFM1P61960 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UFM1P61960 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UFM1P61960 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UFM1P61960 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UFM1P61960 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UFM1P61960 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UFM1P61960 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UFM1P61960 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UFM1P61960 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UFM1P61960 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UFM1P61960 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UFM1P61960 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UFM1P61960 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UFM1P61960 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UFM1P61960 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UFM1P61960 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UFM1P61960 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UFM1P61960 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UFM1P61960 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UFM1P61960 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
UFM1P61960 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UFM1P61960 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UFM1P61960 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UFM1P61960 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UFM1P61960 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UFM1P61960 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UFM1P61960 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
UFM1P61960 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UFM1P61960 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UFM1P61960 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UFM1P61960 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UFM1P61960 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UFM1P61960 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UFM1P61960 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UFM1P61960 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UFM1P61960 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UFM1P61960 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
UFM1P61960 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UFM1P61960 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UFM1P61960 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UFM1P61960 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UFM1P61960 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UFM1P61960 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UFM1P61960 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UFM1P61960 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UFM1P61960 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UFM1P61960 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UFM1P61960 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UFM1P61960 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UFM1P61960 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UFM1P61960 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UFM1P61960 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UFM1P61960 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UFM1P61960 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UFM1P61960 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UFM1P61960 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UFM1P61960 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UFM1P61960 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UFM1P61960 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UFM1P61960 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UFM1P61960 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UFM1P61960 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms