Protein–RNA interactions for Protein: P59998

ARPC4, Actin-related protein 2/3 complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC4P59998 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARPC4P59998 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms