Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC1A1P43005 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC1A1P43005 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC1A1P43005 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC1A1P43005 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC1A1P43005 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC1A1P43005 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC1A1P43005 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC1A1P43005 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC1A1P43005 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC1A1P43005 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC1A1P43005 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC1A1P43005 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC1A1P43005 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC1A1P43005 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC1A1P43005 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC1A1P43005 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC1A1P43005 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC1A1P43005 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC1A1P43005 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC1A1P43005 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC1A1P43005 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC1A1P43005 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC1A1P43005 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC1A1P43005 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC1A1P43005 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC1A1P43005 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC1A1P43005 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC1A1P43005 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC1A1P43005 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC1A1P43005 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC1A1P43005 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC1A1P43005 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC1A1P43005 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC1A1P43005 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC1A1P43005 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC1A1P43005 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC1A1P43005 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC1A1P43005 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC1A1P43005 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC1A1P43005 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC1A1P43005 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC1A1P43005 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC1A1P43005 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC1A1P43005 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC1A1P43005 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC1A1P43005 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC1A1P43005 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC1A1P43005 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC1A1P43005 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC1A1P43005 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC1A1P43005 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC1A1P43005 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC1A1P43005 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC1A1P43005 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC1A1P43005 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC1A1P43005 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC1A1P43005 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC1A1P43005 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC1A1P43005 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC1A1P43005 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC1A1P43005 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC1A1P43005 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC1A1P43005 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC1A1P43005 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC1A1P43005 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC1A1P43005 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC1A1P43005 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC1A1P43005 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC1A1P43005 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC1A1P43005 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC1A1P43005 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC1A1P43005 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC1A1P43005 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC1A1P43005 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC1A1P43005 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC1A1P43005 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC1A1P43005 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms