Protein–RNA interactions for Protein: P41180

CASR, Extracellular calcium-sensing receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASRP41180 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASRP41180 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASRP41180 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASRP41180 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CASRP41180 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASRP41180 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASRP41180 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASRP41180 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASRP41180 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASRP41180 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASRP41180 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASRP41180 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASRP41180 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASRP41180 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASRP41180 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASRP41180 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASRP41180 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASRP41180 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASRP41180 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASRP41180 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASRP41180 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASRP41180 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASRP41180 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CASRP41180 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASRP41180 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASRP41180 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASRP41180 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASRP41180 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASRP41180 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CASRP41180 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASRP41180 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASRP41180 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASRP41180 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASRP41180 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASRP41180 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASRP41180 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASRP41180 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASRP41180 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASRP41180 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASRP41180 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASRP41180 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASRP41180 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASRP41180 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASRP41180 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASRP41180 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASRP41180 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASRP41180 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASRP41180 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASRP41180 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASRP41180 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASRP41180 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASRP41180 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASRP41180 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASRP41180 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASRP41180 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASRP41180 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASRP41180 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASRP41180 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASRP41180 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASRP41180 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASRP41180 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASRP41180 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASRP41180 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASRP41180 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASRP41180 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASRP41180 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASRP41180 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CASRP41180 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CASRP41180 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CASRP41180 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASRP41180 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASRP41180 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASRP41180 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASRP41180 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASRP41180 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CASRP41180 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASRP41180 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASRP41180 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASRP41180 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASRP41180 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASRP41180 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASRP41180 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASRP41180 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASRP41180 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASRP41180 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASRP41180 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASRP41180 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASRP41180 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASRP41180 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASRP41180 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASRP41180 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASRP41180 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASRP41180 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASRP41180 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASRP41180 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASRP41180 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASRP41180 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASRP41180 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASRP41180 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASRP41180 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms