Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 ST3GAL6-218ENST00000486334 750 ntTSL 55.39□□□□□ -1.551e-7■■■□□ 15.5
GTF2F1P35269 SHANK2-216ENST00000482659 381 ntTSL 34.84□□□□□ -1.631e-7■■■□□ 15.5
GTF2F1P35269 TTYH3-203ENST00000403167 4263 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.092e-6■■■□□ 15.5
GTF2F1P35269 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.676e-10■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.546e-10■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.46e-10■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 DDT-205ENST00000428792 333 ntTSL 27.99□□□□□ -1.136e-10■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.592e-6■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.592e-6■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.22e-6■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.112e-6■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.165e-8■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 UBE2S-202ENST00000587845 743 ntTSL 226.31■■□□□ 1.85e-8■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.735e-8■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 UBTF-214ENST00000537550 1085 ntTSL 226.25■■□□□ 1.799e-7■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.645e-7■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 RNF111-205ENST00000559160 900 ntTSL 324.68■■□□□ 1.549e-7■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 SHROOM1-204ENST00000440118 1080 ntTSL 222.09■■□□□ 1.137e-8■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 SLC22A18-210ENST00000492567 684 ntTSL 221.7■■□□□ 1.065e-7■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 SEC63-203ENST00000446496 583 ntTSL 421.42■■□□□ 1.029e-7■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.999e-7■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 MAP2K7-206ENST00000475022 1519 ntTSL 1 (best)21.02■□□□□ 0.969e-7■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 POLRMT-201ENST00000587057 1229 ntTSL 520.99■□□□□ 0.959e-7■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 POLRMT-203ENST00000589961 490 ntTSL 320.65■□□□□ 0.99e-7■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.869e-7■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.799e-7■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.795e-7■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.765e-7■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.739e-7■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 RNF111-208ENST00000559757 541 ntTSL 418.61■□□□□ 0.579e-7■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 DUS3L-208ENST00000590110 977 ntTSL 218.54■□□□□ 0.569e-7■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 TACC3-204ENST00000466077 583 ntTSL 218.25■□□□□ 0.519e-7■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.515e-7■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.429e-7■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 DUS3L-204ENST00000589085 2301 ntTSL 517.49■□□□□ 0.399e-7■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.369e-7■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 TACC3-209ENST00000484651 2715 ntTSL 216.87■□□□□ 0.299e-7■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 POLRMT-207ENST00000592633 469 ntTSL 216.85■□□□□ 0.299e-7■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.259e-7■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.157e-8■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 DPP9-214ENST00000598800 3098 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.19e-7■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 DPP9-204ENST00000595327 423 ntTSL 315.34■□□□□ 0.059e-7■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 RNF111-201ENST00000348370 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.039e-7■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 PRPF6-201ENST00000266079 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -09e-7■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.019e-7■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 DPP9-208ENST00000597253 909 ntTSL 214.89□□□□□ -0.039e-7■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 TACC3-210ENST00000485989 726 ntTSL 314.18□□□□□ -0.149e-7■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 C19orf47-208ENST00000582783 3628 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.179e-7■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 DPP9-201ENST00000262960 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.239e-7■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 DPP9-207ENST00000597145 4257 ntTSL 213.11□□□□□ -0.319e-7■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 AGPAT4-203ENST00000366911 7705 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.469e-7■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 DPP9-203ENST00000594671 3851 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.479e-7■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 RNF111-202ENST00000557998 4803 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.519e-7■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 AGPAT4-204ENST00000436279 875 ntTSL 1 (best)11.84□□□□□ -0.519e-7■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 CEP192-204ENST00000507064 706 ntTSL 311.78□□□□□ -0.529e-7■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 AGPAT4-202ENST00000366905 942 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.539e-7■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 TACC3-206ENST00000470136 650 ntTSL 311.28□□□□□ -0.69e-7■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 AGPAT4-201ENST00000320285 7865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.79e-7■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 CEP192-214ENST00000589596 3793 ntAPPRIS ALT2 TSL 28.81□□□□□ -19e-7■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 SEC63-202ENST00000429168 647 ntTSL 58.74□□□□□ -1.019e-7■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 SEC63-209ENST00000484803 724 ntTSL 28.74□□□□□ -1.019e-7■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 POLRMT-204ENST00000590336 380 ntTSL 38.7□□□□□ -1.029e-7■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 KIAA0100-213ENST00000582417 574 ntTSL 37.8□□□□□ -1.169e-7■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 KIAA0100-204ENST00000577261 862 ntTSL 37.79□□□□□ -1.169e-7■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 OLA1-208ENST00000462000 656 ntTSL 26.84□□□□□ -1.319e-7■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 DPP9-217ENST00000599998 581 ntTSL 46.6□□□□□ -1.359e-7■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.629e-7■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 TUBGCP6-202ENST00000425018 1509 ntTSL 1 (best)21.5■■□□□ 1.036e-7■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 TUBGCP6-207ENST00000491449 4044 ntTSL 514.21□□□□□ -0.136e-7■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.535e-11■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 RAD23B-205ENST00000457811 811 ntTSL 38.27□□□□□ -1.095e-11■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.195e-11■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.014e-10■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 12e-7■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 MFGE8-207ENST00000558352 1031 ntTSL 219.9■□□□□ 0.782e-7■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 MFGE8-212ENST00000559997 531 ntTSL 519.9■□□□□ 0.782e-7■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 SEPT11-210ENST00000510641 1870 ntTSL 1 (best)19.65■□□□□ 0.742e-7■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.682e-7■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.234e-10■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.232e-7■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 RAVER1-204ENST00000592208 4693 ntTSL 1 (best)16.29■□□□□ 0.24e-10■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 RAVER1-205ENST00000593136 500 ntTSL 515.17■□□□□ 0.024e-10■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.012e-7■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 METTL22-205ENST00000562151 520 ntTSL 514.87□□□□□ -0.032e-7■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 MFGE8-211ENST00000559770 680 ntTSL 214.7□□□□□ -0.062e-7■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 RAVER1-201ENST00000293677 3595 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.14e-10■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 C20orf96-203ENST00000400269 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.122e-7■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 COPS5-203ENST00000517736 1621 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.152e-7■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 METTL22-214ENST00000565866 561 ntTSL 313.5□□□□□ -0.252e-7■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 RAVER1-208ENST00000617231 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.334e-10■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 C20orf96-201ENST00000360321 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.452e-7■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 COPS5-205ENST00000518374 1451 ntTSL 211.98□□□□□ -0.492e-7■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 AC104170.1-201ENST00000415031 255 ntTSL 311.73□□□□□ -0.532e-7■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 AC104170.1-202ENST00000426017 362 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.692e-7■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 COPS5-211ENST00000521509 3826 ntTSL 510.63□□□□□ -0.712e-7■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 COPS5-201ENST00000357849 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.892e-7■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 COPS5-213ENST00000523890 1086 ntTSL 39.27□□□□□ -0.932e-7■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 COPS5-210ENST00000521386 5691 ntTSL 1 (best)8.07□□□□□ -1.122e-7■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 COPS5-212ENST00000523086 717 ntTSL 26.75□□□□□ -1.332e-7■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 PPP1R42-202ENST00000517834 610 ntTSL 45.64□□□□□ -1.512e-7■■■□□ 15.4
Retrieved 100 of 18,214 protein–RNA pairs in 410.9 ms