Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN7P35236 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms