Protein–RNA interactions for Protein: P31321

PRKAR1B, cAMP-dependent protein kinase type I-beta regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAR1BP31321 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAR1BP31321 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms