Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCL3P19876 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms