Protein–RNA interactions for Protein: P18846

ATF1, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF1P18846 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF1P18846 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF1P18846 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF1P18846 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF1P18846 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF1P18846 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF1P18846 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF1P18846 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF1P18846 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF1P18846 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF1P18846 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF1P18846 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF1P18846 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF1P18846 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF1P18846 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF1P18846 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF1P18846 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF1P18846 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF1P18846 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF1P18846 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF1P18846 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF1P18846 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF1P18846 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF1P18846 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF1P18846 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF1P18846 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF1P18846 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF1P18846 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF1P18846 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF1P18846 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF1P18846 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATF1P18846 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATF1P18846 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATF1P18846 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATF1P18846 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATF1P18846 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATF1P18846 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATF1P18846 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATF1P18846 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATF1P18846 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATF1P18846 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATF1P18846 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATF1P18846 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATF1P18846 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATF1P18846 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATF1P18846 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATF1P18846 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATF1P18846 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATF1P18846 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATF1P18846 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATF1P18846 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATF1P18846 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATF1P18846 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATF1P18846 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATF1P18846 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATF1P18846 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATF1P18846 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATF1P18846 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATF1P18846 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATF1P18846 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATF1P18846 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATF1P18846 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATF1P18846 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATF1P18846 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATF1P18846 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATF1P18846 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATF1P18846 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATF1P18846 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATF1P18846 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATF1P18846 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATF1P18846 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATF1P18846 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATF1P18846 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATF1P18846 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATF1P18846 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATF1P18846 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATF1P18846 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATF1P18846 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATF1P18846 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATF1P18846 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATF1P18846 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATF1P18846 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATF1P18846 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATF1P18846 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATF1P18846 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATF1P18846 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATF1P18846 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATF1P18846 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATF1P18846 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATF1P18846 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATF1P18846 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATF1P18846 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATF1P18846 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATF1P18846 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATF1P18846 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATF1P18846 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATF1P18846 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATF1P18846 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATF1P18846 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATF1P18846 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms