Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 OR4K13-203ENST00000641904 5684 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms