Protein–RNA interactions for Protein: P10909

CLU, Clusterin, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUP10909 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLUP10909 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLUP10909 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLUP10909 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLUP10909 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLUP10909 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLUP10909 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLUP10909 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLUP10909 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLUP10909 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLUP10909 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLUP10909 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLUP10909 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLUP10909 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLUP10909 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLUP10909 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLUP10909 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLUP10909 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLUP10909 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLUP10909 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLUP10909 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLUP10909 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLUP10909 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLUP10909 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLUP10909 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLUP10909 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLUP10909 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLUP10909 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLUP10909 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLUP10909 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLUP10909 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLUP10909 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CLUP10909 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLUP10909 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLUP10909 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLUP10909 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CLUP10909 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLUP10909 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLUP10909 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLUP10909 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLUP10909 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLUP10909 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLUP10909 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLUP10909 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLUP10909 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CLUP10909 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLUP10909 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLUP10909 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLUP10909 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLUP10909 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLUP10909 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLUP10909 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLUP10909 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLUP10909 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLUP10909 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLUP10909 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLUP10909 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLUP10909 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLUP10909 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLUP10909 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLUP10909 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLUP10909 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLUP10909 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLUP10909 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLUP10909 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLUP10909 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLUP10909 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLUP10909 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLUP10909 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLUP10909 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLUP10909 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLUP10909 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLUP10909 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLUP10909 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLUP10909 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLUP10909 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLUP10909 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLUP10909 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CLUP10909 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLUP10909 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLUP10909 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLUP10909 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLUP10909 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLUP10909 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLUP10909 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLUP10909 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLUP10909 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLUP10909 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLUP10909 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLUP10909 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLUP10909 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLUP10909 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLUP10909 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLUP10909 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLUP10909 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLUP10909 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLUP10909 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLUP10909 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLUP10909 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CLUP10909 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms