Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms