Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNKO75909 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNKO75909 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNKO75909 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNKO75909 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNKO75909 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNKO75909 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNKO75909 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNKO75909 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNKO75909 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNKO75909 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNKO75909 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNKO75909 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNKO75909 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNKO75909 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNKO75909 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNKO75909 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNKO75909 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNKO75909 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNKO75909 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNKO75909 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNKO75909 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNKO75909 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNKO75909 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNKO75909 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNKO75909 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNKO75909 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNKO75909 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNKO75909 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNKO75909 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNKO75909 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNKO75909 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNKO75909 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNKO75909 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNKO75909 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNKO75909 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNKO75909 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNKO75909 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNKO75909 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNKO75909 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNKO75909 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNKO75909 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNKO75909 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNKO75909 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNKO75909 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNKO75909 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNKO75909 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNKO75909 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNKO75909 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNKO75909 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNKO75909 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNKO75909 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNKO75909 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNKO75909 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNKO75909 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNKO75909 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNKO75909 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNKO75909 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNKO75909 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNKO75909 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNKO75909 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNKO75909 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNKO75909 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNKO75909 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNKO75909 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNKO75909 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNKO75909 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNKO75909 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNKO75909 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNKO75909 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNKO75909 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNKO75909 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNKO75909 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
CCNKO75909 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
CCNKO75909 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNKO75909 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNKO75909 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNKO75909 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNKO75909 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNKO75909 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNKO75909 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNKO75909 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNKO75909 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNKO75909 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNKO75909 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNKO75909 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNKO75909 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNKO75909 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNKO75909 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNKO75909 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNKO75909 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNKO75909 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNKO75909 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNKO75909 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNKO75909 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNKO75909 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNKO75909 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNKO75909 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNKO75909 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNKO75909 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms