Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHF1O43189 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHF1O43189 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHF1O43189 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHF1O43189 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHF1O43189 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHF1O43189 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHF1O43189 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PHF1O43189 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHF1O43189 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHF1O43189 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHF1O43189 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHF1O43189 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHF1O43189 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHF1O43189 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF1O43189 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF1O43189 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF1O43189 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF1O43189 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF1O43189 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF1O43189 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF1O43189 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF1O43189 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF1O43189 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF1O43189 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF1O43189 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF1O43189 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF1O43189 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF1O43189 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF1O43189 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF1O43189 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF1O43189 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF1O43189 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF1O43189 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF1O43189 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF1O43189 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF1O43189 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF1O43189 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF1O43189 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF1O43189 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF1O43189 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF1O43189 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF1O43189 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF1O43189 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF1O43189 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF1O43189 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF1O43189 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF1O43189 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF1O43189 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF1O43189 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF1O43189 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF1O43189 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF1O43189 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF1O43189 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF1O43189 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF1O43189 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF1O43189 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF1O43189 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF1O43189 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF1O43189 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF1O43189 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHF1O43189 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF1O43189 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF1O43189 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF1O43189 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF1O43189 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF1O43189 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF1O43189 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF1O43189 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF1O43189 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF1O43189 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF1O43189 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF1O43189 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF1O43189 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF1O43189 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF1O43189 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF1O43189 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF1O43189 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF1O43189 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF1O43189 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF1O43189 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF1O43189 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF1O43189 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF1O43189 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF1O43189 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF1O43189 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF1O43189 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF1O43189 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF1O43189 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF1O43189 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF1O43189 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF1O43189 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF1O43189 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF1O43189 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF1O43189 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF1O43189 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF1O43189 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF1O43189 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF1O43189 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHF1O43189 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms