Protein–RNA interactions for Protein: O15540

FABP7, Fatty acid-binding protein, brain, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FABP7O15540 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FABP7O15540 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FABP7O15540 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FABP7O15540 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FABP7O15540 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FABP7O15540 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FABP7O15540 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FABP7O15540 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FABP7O15540 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FABP7O15540 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FABP7O15540 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FABP7O15540 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FABP7O15540 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FABP7O15540 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FABP7O15540 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FABP7O15540 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FABP7O15540 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FABP7O15540 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FABP7O15540 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FABP7O15540 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FABP7O15540 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FABP7O15540 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FABP7O15540 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FABP7O15540 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FABP7O15540 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FABP7O15540 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FABP7O15540 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FABP7O15540 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FABP7O15540 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FABP7O15540 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FABP7O15540 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FABP7O15540 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FABP7O15540 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FABP7O15540 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FABP7O15540 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FABP7O15540 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FABP7O15540 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FABP7O15540 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FABP7O15540 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FABP7O15540 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FABP7O15540 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FABP7O15540 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FABP7O15540 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FABP7O15540 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FABP7O15540 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FABP7O15540 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FABP7O15540 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FABP7O15540 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FABP7O15540 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FABP7O15540 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FABP7O15540 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FABP7O15540 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FABP7O15540 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FABP7O15540 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FABP7O15540 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FABP7O15540 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FABP7O15540 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FABP7O15540 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FABP7O15540 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FABP7O15540 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FABP7O15540 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FABP7O15540 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FABP7O15540 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FABP7O15540 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FABP7O15540 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FABP7O15540 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FABP7O15540 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FABP7O15540 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FABP7O15540 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FABP7O15540 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FABP7O15540 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FABP7O15540 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FABP7O15540 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FABP7O15540 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FABP7O15540 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FABP7O15540 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FABP7O15540 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FABP7O15540 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FABP7O15540 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FABP7O15540 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FABP7O15540 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FABP7O15540 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FABP7O15540 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FABP7O15540 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FABP7O15540 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FABP7O15540 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FABP7O15540 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FABP7O15540 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FABP7O15540 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FABP7O15540 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FABP7O15540 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FABP7O15540 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FABP7O15540 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FABP7O15540 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
FABP7O15540 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FABP7O15540 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FABP7O15540 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FABP7O15540 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FABP7O15540 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FABP7O15540 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms