Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms