Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms