Protein–RNA interactions for Protein: A4D1E1

ZNF804B, Zinc finger protein 804B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF804BA4D1E1 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF804BA4D1E1 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF804BA4D1E1 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF804BA4D1E1 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF804BA4D1E1 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF804BA4D1E1 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF804BA4D1E1 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF804BA4D1E1 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF804BA4D1E1 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF804BA4D1E1 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms