Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms