Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms