Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SBNO2Q9Y2G9 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms