Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms