Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms