Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU7

DBF4, Protein DBF4 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBF4Q9UBU7 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DBF4Q9UBU7 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DBF4Q9UBU7 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms